PayPalはインターネット上での事実上の金銭取引手段としての地位を確立しています。しかしながら、PayPalの事業慣行や紛争解決の慣行は、PayPalが可能な限り資金を保有し続けることに重点を置いているように思われ、一部の批判を招いています。
ユーザーは、オンライン商品、特にeBayのようなオークションサイトでの商品購入に信頼できる決済手段を求めており、eBayがPayPalを買収したのもそのためです。さらに重要なのは、ユーザーが一定レベルの保証と詐欺に対する保護を求めていることです。詐欺とは、販売者が商品を配達しなかったり、オンラインの説明と異なる商品を送付したりすること、あるいは購入者が商品を受け取った後に代金を支払わないことなど、様々な詐欺行為に対する保護です。
PayPalが処理する取引の膨大な量を考えると、毎日かなりの数の苦情や非難を受けていると想定するのは妥当です。当然のことながら、PayPalはクレームの調査と紛争解決のために常に注意を払い、積極的に行動する必要があります。
しかし、一部の販売者は、PayPalの紛争解決手続きが、どの取引においても購入者に有利に偏っていると感じています。また、PayPalは資金の引き出しを意図的に遅らせていると考える人もいます。なぜなら、PayPalは自社の口座に資金を預けておくことで、利息収入を得たり、その資金をレバレッジして利益を上げたりできるからです。
最近の事例では、PayPalがPayPalの出品者から100万ドル近くの資金を盗んでいました。Notchという名のゲーム開発者が9月10日にブログに投稿し、「彼らは私のアカウントを不特定の理由で制限しました（不審な出金または入金！すごい、その詳細な情報に感謝します）。そして、曖昧な書類を大量に要求しました。私は要求されたものを提出するために最善を尽くしました。」と述べています。
ブログ記事はさらにこう説明している。「私の口座はまだ制限されています。3回電話しましたが、審査中だと言われ続けています。最近、解決にはさらに2週間かかると言われました。何か問題が起こっていると判断された場合は、資金は差し押さえられるとのことでした。」
PayPal側から見れば、これは異例のケースです。PayPalを含むすべての関係者を守るために、突発的に収入が急増したアカウントにPayPalが警告を出すのは理にかなっているように思われます。
PayPalで販売している人で、PayPalアカウントにこれほどの金額を滞留させている人はほとんどいません。実際、ノッチ氏は毎週資金を引き出すのが習慣だったものの、ゲームの売上が急上昇したタイミングでPayPalがアカウントを凍結したため、問題が解決するまでの間に残高が急上昇したと説明しています。
しかし、たとえ小規模であっても、PayPalを利用して事業を営む販売業者はPayPalからの収入に依存しており、自分たちの資金がPayPalの言いなりになって無期限に留保されることを好ましく思っていません。そのため、一部の企業は、オンライン決済手段としてGoogle CheckoutやAmazon PaymentsといったPayPalの代替手段を検討しています。
